Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms