Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Klhdc3Q8VEM9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Klhdc3Q8VEM9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Klhdc3Q8VEM9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Klhdc3Q8VEM9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Klhdc3Q8VEM9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Klhdc3Q8VEM9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Klhdc3Q8VEM9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Klhdc3Q8VEM9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klhdc3Q8VEM9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klhdc3Q8VEM9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klhdc3Q8VEM9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klhdc3Q8VEM9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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