Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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