Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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