Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms