Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms