Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Zbtb40Q6PCS8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms