Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms