Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SspnQ62147 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SspnQ62147 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SspnQ62147 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SspnQ62147 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SspnQ62147 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SspnQ62147 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SspnQ62147 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SspnQ62147 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SspnQ62147 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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