Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms