Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms