Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Fam208bQ5DTT3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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