Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms