Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39dQ0VF76 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms