Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pate4Q09098 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms