Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Sh3bp2Q06649 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Sh3bp2Q06649 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Sh3bp2Q06649 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Sh3bp2Q06649 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Sh3bp2Q06649 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Sh3bp2Q06649 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp2Q06649 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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