Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col1a2Q01149 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms