Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms