Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Bop1P97452 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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