Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx1bP61264 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms