Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtlP38585 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TtlP38585 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtlP38585 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtlP38585 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms