Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Casp2P29594 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Casp2P29594 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms