Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18530 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18530 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18530 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms