Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms