Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm2888K7N746 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2888K7N746 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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