Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms