Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx60E9PZQ1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms