Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Herc1E9PZP8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms