Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms