Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc175E9PVB3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc175E9PVB3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms