Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms