Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8nlA2ABX0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms