Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Itgb4A2A863 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Itgb4A2A863 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Itgb4A2A863 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Itgb4A2A863 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms