Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
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