Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma1Q9R1P4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms