Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms