Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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