Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RTRAFQ9CQE8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms