Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PpcsQ8VDG5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms