Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Slc6a20aQ8VDB9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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