Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh10Q8VCH7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms