Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm1Q8K377 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Lrrtm1Q8K377 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrtm1Q8K377 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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