Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rfwd3Q8CIK8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rfwd3Q8CIK8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rfwd3Q8CIK8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rfwd3Q8CIK8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rfwd3Q8CIK8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rfwd3Q8CIK8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rfwd3Q8CIK8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rfwd3Q8CIK8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfwd3Q8CIK8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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