Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh13Q8CEE7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms