Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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