Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamb3Q61087 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms