Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn13Q3UW68 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn13Q3UW68 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms