Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Q3U6N9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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