Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK2Q13002 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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