Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms